AVIS DE SOUTENANCE de Monsieur MAJD ABAZID

L’Ecole doctorale : Ecole Doctorale de l’Institut Polytechnique de Paris
et le Laboratoire de recherche SAMOVAR – Services rĂ©partis, Architectures, MOdĂ©lisation, Validation, Administration des RĂ©seaux

présentent

l’AVIS DE SOUTENANCE de Monsieur MAJD ABAZID

AutorisĂ© Ă  prĂ©senter ses travaux en vue de l’obtention du Doctorat de l’Institut Polytechnique de Paris, prĂ©parĂ© Ă  TĂ©lĂ©com SudParis en :

Mathématiques et Informatique

« Etude topologique de l’organisation fonctionnelle cĂ©rĂ©brale aux stades prĂ©coces de la maladie d’Alzheimer par Ă©lectroencĂ©phalographie »

le mardi 13 décembre 2022 à 15h00

Amphi 4
19 rue Marguerite Perey 91120 Palaiseau

Lien zoom:
https://telecom-paris.zoom.us/j/98403568641?pwd=STUwSndobUNDSTg5bFFsbWUvYS85dz09
ID de rĂ©union : 984 0356 8641
Code secret : 495693

Membres du jury :

M. JĂ©rome BOUDY, Professeur, TĂ©lĂ©com SudParis, FRANCE – Directeur de thĂšse
M. Sylvain  CHEVALLIER, Professeur des universitĂ©s, UniversitĂ© Paris-Saclay, FRANCE – Rapporteur
M. Jordi  SOLĂ©-CASALS, Professor, UniversitĂ© de Vic, ESPAGNE – Rapporteur
Mme Nesma HOUMANI, MaĂźtresse de confĂ©rences, Telecom SudParis, FRANCE – Co-encadrante de thĂšse
Mme Kiyoka KINUGAWA BOURRON, Professeure des universitĂ©s – praticienne hospitaliĂšre, Sorbonne UniversitĂ©/CNRS, UMR 8256 Biological Adaptation and Aging, FRANCE – Examinatrice
M. GĂ©rard DRAY, Professeur, IMT Mines Ales, FRANCE – Examinateur


Résumé :

L’Ă©lectroencĂ©phalographie (EEG) est encore considĂ©rĂ©e de nos jours comme une technique de neuroimagerie trĂšs utile dans les applications cliniques, adaptĂ©e aux patients souffrant de troubles cognitifs et physiques, ainsi qu’aux tests Ă  grande Ă©chelle. L’EEG est une technologie non invasive, peu coĂ»teuse et facilement accessible. Elle se caractĂ©rise par une haute rĂ©solution temporelle, ce qui est crucial pour le suivi de la dynamique cĂ©rĂ©brale. Plusieurs travaux dans la littĂ©rature ont exploitĂ© l’EEG pour Ă©tudier les altĂ©rations de l’activitĂ© cĂ©rĂ©brale liĂ©es aux maladies neurodĂ©gĂ©nĂ©ratives, notamment la maladie d’Alzheimer (MA). La MA est une maladie neurodĂ©gĂ©nĂ©rative chronique qui entraĂźne un dĂ©clin progressif des fonctions cognitives, ainsi que des troubles du comportement et une perte insidieuse d’autonomie au quotidien. En l’absence de traitements curatifs, nous observons un intĂ©rĂȘt croissant Ă  la caractĂ©risation de l’activitĂ© cĂ©rĂ©brale aux stades prĂ©coces de la maladie. Le stade prĂ©clinique de la MA est asymptomatique, mais les lĂ©sions cĂ©rĂ©brales dues Ă  la MA sont prĂ©sentes. A ce stade, on parle de troubles cognitifs subjectifs (subjective cognitive impairments, SCI). Au stade prodromal, les patients atteints de troubles cognitifs lĂ©gers (mild cognitive impairment, MCI) prĂ©sentent des troubles de la mĂ©moire mesurables, mais leur capacitĂ© fonctionnelle est maintenue. Les patients atteints de troubles subjectifs ou lĂ©gers prĂ©sentent un risque Ă©levĂ© de dĂ©velopper la MA. Cette thĂšse s’intĂ©resse au diagnostic prĂ©coce de la MA aux stades prĂ©clinique et prodromal en utilisant l’EEG au repos, et aborde l’analyse des rĂ©seaux cĂ©rĂ©braux en Ă©tudiant la connectivitĂ© fonctionnelle Ă  diffĂ©rents stades cliniques du dĂ©clin cognitif (SCI, MCI et MA au stade lĂ©ger). Pour cela, nous avons menĂ© une Ă©tude rĂ©trospective en exploitant une base de donnĂ©es clinique qui contient des signaux EEG enregistrĂ©s en conditions rĂ©elles. En premier lieu, nous avons proposĂ© d’exploiter une mesure d’entropie, appelĂ©e « Epoch-based Entropy » (EpEn), pour quantifier la connectivitĂ© fonctionnelle. Cette mesure repose sur une modĂ©lisation statistique fine des signaux EEG avec des modĂšles de Markov cachĂ©s. Cette mesure caractĂ©rise les changements spatio-temporels des signaux EEG en quantifiant le contenu d’information dans les signaux au niveau temporel et spatial. Par la suite, nous avons effectuĂ© une analyse topologique du rĂ©seau cĂ©rĂ©bral cortical de maniĂšre diffĂ©rentielle, en exploitant la thĂ©orie des graphes. La contribution de notre travail est double. En effet, il s’agit du premier travail qui : (i) aborde l’analyse du rĂ©seau cĂ©rĂ©bral chez les patients ayant des troubles subjectifs, des troubles lĂ©gers et la MA au stade lĂ©ger, et (ii) combine la mesure d’entropie Ă  la thĂ©orie des graphes puisque nous avons dĂ©montrĂ© son efficacitĂ© Ă  quantifier les changements spatio-temporels liĂ©s Ă  la MA. Dans cette thĂšse, nous avons aussi abordĂ© le problĂšme de la grande quantitĂ© d’information extraite des signaux EEG, analysĂ©s sur plusieurs bandes de frĂ©quences (delta, theta, alpha, beta), plusieurs Ă©lectrodes, et plusieurs Ă©chelles de densitĂ© de rĂ©seau (seuillages multiples des graphes). Par consĂ©quent, une autre contribution Ă  ce travail de thĂšse concerne l’extraction de marqueurs EEG les plus pertinents pour discriminer automatiquement les trois groupes de patients. Ainsi, nous avons proposĂ© une mĂ©thode hiĂ©rarchique pour l’analyse des signaux EEG, permettant d’identifier les descripteurs les plus pertinents Ă  partir d’une grande quantitĂ© d’information issue d’une seule mesure de connectivitĂ© fonctionnelle. Enfin, nous avons Ă©valuĂ© la corrĂ©lation entre les marqueurs numĂ©riques extraits des signaux EEG et les biomarqueurs cliniques Ă  notre disposition (MMSE, RL/RI-16, BREF).


Abstract : « Topological study of the brain functional organization at the early stages of Alzheimer’s disease using electroencephalography »

Electroencephalography (EEG) is still considered nowadays as a convenient neuroimaging technique in clinical applications, suitable for cognitively and physically disabled patients, as well as for serial tests. In fact, EEG is a non-invasive, cost-effective, and mobile technology. It is characterized by a high temporal resolution, which is crucial for the analysis of fast brain functional dynamics. There is a rich literature addressing the use of EEG to investigate brain activity alterations due to neurodegenerative diseases, especially Alzheimer’s disease (AD). AD is a chronic neurodegenerative disease that leads to progressive decline of cognitive functions along with behavioral disorders and insidious loss of autonomy in daily living activities. We observe a growing interest in the earlier stages of the disease since curative treatments are still lacking. The preclinical stage of AD is asymptomatic, but the brain lesions due to AD are present. At this phase, the term of subjective cognitive impairment (SCI) has been recently defined. In the prodromal stage, mild cognitive impairment (MCI) patients show measurable memory impairments but their functional capacity is maintained. SCI and MCI patients are at high risk of developing AD. This thesis investigates the early diagnosis of AD at preclinical and prodromal stages using resting-state EEG, and addresses brain network analysis by studying the functional connectivity over several clinical stages of cognitive decline (SCI, MCI and Mild AD). To this end, we conduct a retrospective study using a clinical database that contains EEG signals recorded in real-life conditions. We first propose to exploit an entropy measure, termed “epoch-based entropy” (EpEn), as a measure of functional connectivity, that relies on a refined statistical modeling of EEG signals based on Hidden Markov Models. This measure characterizes the spatiotemporal changes in EEG signals by quantifying the information content of EEG signals, both at the time and spatial levels. Furthermore, we conduct a topological brain network analysis over the three stages of cognitive decline by employing the Graph Theory. The novelty of our work is twofold. Actually, this is the first work that: (i) addresses EEG brain network analysis over SCI, MCI and Mild AD stages simultaneously, and (ii) combines EpEn to Graph Theory since we have shown its effectiveness in quantifying the complete spatiotemporal alteration due to AD. In this thesis, we decided to invest the largest amount of EEG information for brain network analysis, by exploiting several frequency ranges (delta, theta, alpha, beta), several electrodes locations (instead of regions), and several network density scales (multiple graph thresholding). Therefore, another issue tackled in this thesis concerns the identification of relevant EEG markers to discriminate automatically between SCI, MCI and AD patients in the context of graph analysis framework. To this end, we propose an automatic hierarchical method for EEG analysis, which allows the extraction of relevant markers from large amount of information based on a single EEG connectivity measure. Finally, we also assess the correlation between the relevant EEG markers and the clinical biomarkers at our disposal (MMSE, RL/RI-16, BREF).